第3代细菌序列是否需要od值进行DNA质量检测?

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三代对DNA有两个要求。一个是DNA的数量。通常,PacbioRSII P6-C4文库测序方法需要10ug以上的样品。
此外,DNA的质量对测序结果有显着影响。
最有影响的是DNA的长度,并且原始DNA长度直接决定了通过最终测序获得的sub_read的读取长度。
由于P6-C4可以获得高达30kb的读数,因此原始DNA的长度优选为至少10kb或更多。
OD值可在一定程度上反映DNA质量和纯度。如果DNA含有此类蛋白质或盐离子以及次级代谢物,则会影响Pacbio序列。
它由序列数据量表示,甚至是正常数据的十分之一。